中國音樂學院音樂學系建立于1981年，前身是北京藝術學院音樂理論學科。音樂學系現設民族音樂、音樂史以及體系音樂三個教研室。中國音樂學院音樂學系教師中擁有博士學位的比例達到90%。音樂學系教師具有較強的教學和科研能力，曾榮獲：北京市優秀教學成果一等獎(民族音樂教學，2005年);北京市“人才強教”學術創新團隊(民族音樂教研室、2006);北京市優秀教學團隊(中國音樂史學教學團隊，2008)北京市教育教學成果一等獎(傳統音樂教學團隊，2008);國家級教育教學成果二等獎(傳統音樂教學團隊，2009);北京市優秀教學團隊(傳統音樂教學團隊，2010)。教師個人也多次榮獲國家、省部級獎項。

　　音樂學系致力于培養具有一定馬克思主義基本理論素養和系統的專業基本知識、具備音樂實踐技能和教學能力的高級專門人材，經過五年的本科階段教育，使其能夠勝任在專業或普通院校、社會文藝團體、藝術研究單位和文化機關、出版及廣播、影視部門從事教學、研究、編輯、評論、管理等方面的工作。

　　建系以來，音樂學系培養本科畢業生200多人，碩士生30多人，其中有數名畢業生在其他院校(含香港與國外留學)進一步深造，獲博士學位。近年來，他們已逐步成為各教學、科研崗位的骨干力量。

　　音樂學系本科必修的本專業課程包括漢族民歌、說唱音樂、戲曲音樂、民族器樂、少數民族民歌、世界民族民間音樂、民族音樂學概論、采風技能、中國古代音樂史、中國近現代音樂史、西方音樂史、音樂美學、古代樂論等專業課程。此外，音樂學系還承擔全院各系音樂學方面上述所有課程的共同課教學;同時，音樂學系教師還為全院開設了20余門選修課程。